Ученый Совет медико-профилактического факультета функционирует с 1963 года. Председателем Ученого совета является декан медико-профилактического факультета, доктор медицинских наук Леванова Людмила Александровна. Периодичность заседаний Ученого совета факультета - 1 раз в два месяца. На заседаниях Ученого совета факультета рассматриваются вопросы организации учебного процесса, воспитательной и методической работы, кроме того, обсуждаются вопросы, связанные с конкурсными выборами на замещение вакантных должностей преподавателей, итогами производственной практики студентов, экзаменационной сессии и государственной итоговой аттестации выпускников. Важным разделом деятельности Ученого совета является контроль за исполнением принятых решений.