Кафедра инфекционных болезней образована в 1961 году. Первой заведующей кафедрой была Анна Марэевна Баэртуева, ученица академика АМН СССР К.В. Бунина, кандидат медицинских наук. Первыми преподавателями кафедры были Анна Григорьевна Докукина, Антонина Федоровна Шевченко, Юрий Леонидович Вечелковский, Виктор Иванович Гладков. В последующем были избраны по конкурсу на должность доцента кафедры В.И. Плотников, ассистентов - А.Ф. Лисина, В.В. Шабалин, Г.Д. Васильева, А.В. Краснов, Л.С. Попова, Н.А. Карпов, О.И. Кулагина.
С 1963 по 1965 гг. кафедру возглавил доцент Мирон Львович Лившиц, в последующем заведующий кафедрой эпидемиологии нашей академии, доктор медицинских наук, профессор, «Заслуженный деятель науки России», академик РАЕН.
С 1965 по 1997 гг. кафедрой заведовал доктор медицинских наук, профессор Федор Григорьевич Мухордов.
Основным научным направлением в деятельности кафедры являлась разработка вопросов диагностики, лечения и профилактики заболеваний, определяющих краевую инфекционную патологию, среди которых были вирусные гепатиты у рабочих химической промышленности и клещевой энцефалит у детей. По данным проблемам защищены докторская диссертация Ф.Г. Мухордовым и кандидатские диссертации Ю.Л. Вечелковским, Ю.Э. Мысливцом, Г.Д. Васильевой, Н.А. Карповым, А.В. Красновым, О.И. Кулагиной, а также опубликованы 2 монографии, 500 научных работ, издано 9 сборников научных работ, 38 методических рекомендаций для врачей и студентов.
Основной задачей кафедры была и остается подготовка высококвалифицированных специалистов, методических материалов для практического здравоохранения по инфекционной патологии, помощь органам здравоохранения. Так обязанности ведущего специалиста ДОЗН Кемеровской области в течение 28 лет выполняла ассистент кафедры, к.м.н. Г.Д. Васильева. В 2008 году Васильевой Галине Дмитриевне присвоено высокое звание «Заслуженный врач России». Профессор Ф.Г. Мухордов был награжден орденом «Знак Почета», знаком «Отличник здравоохранения». Мысливец Ю.Э. награжден знаком «Отличник здравоохранения».
За 55 лет на кафедре подготовлено более 100 клинических ординаторов, которые сегодня трудятся в Российской Федерации, на Украине, Белоруссии.
С сентября 1998 года произошло объединение кафедр инфекционных болезней и детских инфекций. Кафедра детских инфекций была образована в 1971 году в связи с открытием педиатрического факультета. Кафедру возглавил доктор медицинских наук профессор Виктор Николаевич Дроздов, в последующем удостоенный почетного звания «Заслуженный деятель науки РСФСР», а первыми преподавателями кафедры детских инфекций были врачи В. П. Талалаева, В.И. Уткин, Л.А. Оганова, А.П. Плотникова.
В последующие годы после окончания аспирантуры были избраны на должность доцента Н.Н. Афанасьев, ассистентов - Л.Е. Зятикова, Г.И. Кожевина, И.В. Воеводин, Л.М. Берсенева. С 1990 по 1997 гг. кафедру детских инфекций возглавлял доцент Николай Никифорович Афанасьев.
При выполнении НИР на кафедре детских инфекций основное внимание уделялось изучению острых кишечных заболеваний и менингококковой инфекции. Выполнено 700 научных статей, 11 монографий, 17 сборников научных трудов и 44 методических рекомендаций (6 – с грифом УМО).
С 1997 по 2017 гг. кафедрой инфекционных болезней заведовал выпускник 1972 года Кемеровского государственного медицинского института, кандидат медицинских наук, доцент Краснов Алексей Васильевич, награждённый Почетной грамотой Министерства здравоохранения, знаком «Отличник здравоохранения», медалью «За служение Кузбассу». В 2009 году на кафедру пришла врач-педиатр Айнетдинова Алина Леонидовна, которая в 2010 г. защитила кандидатскую диссертацию и с 2016 года работает в должности доцента кафедры инфекционных болезней. В 2010 г. учёным советом МПФ академии был избран на должность ассистента кафедры – Матюшечкин Александр Станиславович.
С 2017 года кафедрой инфекционных болезней заведует выпускница 1985 года Кемеровского государственного медицинского института, кандидат медицинских наук, доцент Пивовар Ольга Ивановна. Продолжают работать на кафедре и ветераны труда: ассистенты – Юрий Эдуардович Мысливец и Галина Ивановна Кожевина. Наряду с ветеранами, в коллективе кафедры плодотворно трудятся молодые преподаватели: ассистенты Ольга Валерьевна Ивойлова (с 2008 года) и Алина Анатольевна Марковская (с 2017 года), которые ведут активный научный поиск и совершенствуют процесс подготовки будущего врача на новый уровень.
